клетки мозга
                Кредит: CC0 Public Domain

Секвенирование одноклеточной РНК является мощным инструментом для изучения клеточного разнообразия, например, при раке, где различные типы опухолевых клеток определяют диагноз, прогноз и ответ на терапию. Одноэлементные технологии генерируют от сотен до тысяч точек данных на выборку, создавая потребность в новых методах для определения популяций клеток в разных ландшафтах из одной клетки.

Ци Лю, доктор философии, Кен Лау, доктор философии и коллеги разработали новый инструмент sc-UniFrac для количественной оценки различных типов клеток в одноклеточных исследованиях. Этот инструмент сравнивает иерархические деревья, которые представляют ландшафты с одной ячейкой, и позволяет идентифицировать ячейки, которые определяют различия, как несбалансированные ветви на деревьях.

Сообщая в PLOS Biology, исследователи продемонстрировали полезность sc-UniFrac для различных применений, включая региональную спецификацию клеток мозга и идентификацию измененных клеток в образцах опухоли. Авторы ожидают, что sc-UniFrac будет способствовать исследованиям отдельных клеток, в частности исследованиям, направленным на отслеживание эволюции популяций опухолевых клеток во время прогрессирования заболевания и реагирования на медикаментозное лечение.




Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *