Ученые упорядочивают более 1000 генов COVID-19, чтобы помочь в ответ на пандемию
                Предоставлено: Университет Шеффилда.

В настоящее время более тысячи последовательностей генома коронавируса были изготовлены в рамках работы, проделанной учеными и клиницистами из Шеффилдского университета и Шеффилдской учебной больницы NHS Foundation Trust.
                                                                                       

Данные являются важной вехой для их работы в составе британского консорциума по составлению карты распространения, поведения и мутаций COVID-19. Он будет полностью опубликован в общедоступной базе данных, используемой исследователями и учеными, работающими над решениями проблемы вспышки коронавируса во всем мире.

При поддержке правительства Великобритании инвестиции в размере 20 миллионов фунтов стерлингов позволили экспертным группам по всей Великобритании совместно работать над быстрым анализом генетического кода образцов коронавируса, циркулирующих в Великобритании. Эта работа направлена ​​на создание разведывательных данных для обмена с государственными учреждениями здравоохранения, больницами, региональными центрами NHS и правительством для борьбы с вирусом.

Путем картирования генома COVID-19 ученые могут отслеживать изменения в вирусе в национальном и глобальном масштабе, что способствует пониманию того, как он распространяется и мутирует, информируя о клинической помощи пациентам и даже спасая жизни.

Консорциум COVID-19 Genomics UK включает в себя NHS, агентства общественного здравоохранения, Институт Wellcome Sanger и многочисленные академические учреждения, включая Университет Шеффилда.

р. Тушан де Сильва, старший клинический лектор и почетный врач-консультант по инфекционным болезням из Университета Шеффилда, возглавляет совместную группу по геномике Sheffield COVID-19. В его состав входят специалисты из Института взаимодействия с патогеном-хозяином Университета Флори, Института трансляционной неврологии Шеффилда (SITraN), Отделения наук о животных и растениях, Отделения молекулярной биологии и биотехнологии и Отделения компьютерных наук.

р. Мэтью Паркер и д-р Деннис Ван руководили анализом биоинформатики проекта в Центре биомедицинских исследований Шеффилда Национального института здравоохранения (NIHR) и Департаменте компьютерных наук.

р. Паркер сказал: «Используя опыт в ядре биоинформатики Шеффилда, мы создали надежный конвейер, который берет геномные данные из вирусных случаев в нашем регионе и сравнивает их с данными со всего мира для выявления новых мутаций. Сотрудничая с нашими национальными и международными партнеры, мы сможем отслеживать распространение вируса, а возможности и опыт, которыми мы располагаем здесь, в Шеффилде, являются ключом к успешному проекту, подобному этому.

«Наша совместная команда быстро расширила свои возможности и разработала новые процессы, чтобы иметь возможность секвенировать геномы в масштабе, которого мы не делали раньше. В настоящее время сотрудники лаборатории секвенируют геномы из образцов, взятых у пациентов с подтвержденными случаями COVID-19. со скоростью более 100 в неделю. «

р. де Сильва сказал: «Рассматривая весь геном вируса у людей, у которых были подтвержденные случаи коронавируса, мы можем отслеживать изменения вируса в национальном и глобальном масштабе, чтобы понять, как он распространяется.

«Эта работа помогает координировать быстрые ответные действия на новые инфекционные заболевания по мере их распространения и видоизменения среди местного населения. Это очень важно для сообщества медицинских исследований, чтобы иметь возможность внести свой вклад в наше понимание вспышек новых инфекционных заболеваний, информируя клинические забота о пациентах и ​​даже спасение жизни. «

Команда работает в партнерстве с консультантом-вирусологом, доктором Кариадом Эвансом, доктором Мохаммадом Раза, доктором Элисон Коуп и консультантом-микробиологом доктором Дэйвом Партриджем из региональной вирусологической лаборатории NHS Фонда Доверия Шеффилда, расположенной в Северном регионе. Главная больница; для реагирования на быстро развивающуюся вспышку вируса в Йоркширском регионе.

р. Кариада Эванс сказала: «У нас есть национальные и международные эксперты по вирусологии, работающие в наших лабораториях, и мы очень гордимся тем, что принимаем участие в этой важной работе, чтобы определить, как ведет себя этот новый вирус и как эти знания могут затем помочь будущему уходу или лечению»./р>




Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *