COVID
Кредит: CC0 Public Domain

Ученые, установившие последовательность образцов вируса из первых подтвержденных случаев COVID-19 в Шотландии, определили множественные внедрения, в основном из европейских стран, таких как Италия, Австрия и Испания, и показали, что первые прививки вируса в Шотландии, вероятно, произошли до Первый в стране подтвержденный случай 1 марта.

Чтобы предоставить своевременную информацию в течение этого критического периода, это исследование было опубликовано на medRxiv и в полном пре-печатном исследовании. Следует отметить, что результаты еще не были рецензированы.

Посмотрев полные последовательности генома SARS-CoV-2, вируса, вызывающего COVID-19, исследователи обнаружили, что вирус был введен не менее 113 раз в течение первых четырех недель вспышки в Шотландии, главным образом из других стран. Европейские страны. Подтвержденные связанные с поездками внедрения SARS-CoV-2 в Шотландию предшествовали как ограничениям на поездки в Великобританию, так и обширным ограничениям в других европейских странах.

Некоторые предполагаемые внедрения вируса не были связаны с зарегистрированными поездками, поэтому авторы пришли к выводу, что несколько ранних внедрений вируса были незамеченными и быстро установили передачу в сообществе в Шотландии. Резкий сдвиг от передачи, связанной с поездками, к устойчивой передаче инфекции в сообществе стал очевиден с 11 марта, через 10 дней после первого выявленного случая.

В ходе исследования изучалось появление вируса в Шотландии в марте. Исследователи получили полные последовательности генома от 466 человек с использованием технологии секвенирования следующего поколения в режиме реального времени для 20% всех подтвержденных диагнозов заболевания.

Эмма Томсон, профессор инфекционных заболеваний в Центре исследований вирусов Университета Глазго MRC, сказала: «Наше исследование подтверждает, что SARS-CoV-2 проник в шотландскую популяцию, по крайней мере, в 113 отдельных введениях, связанных с путешествиями, что привело к кластеры устойчивой передачи от сообщества. Мы выявили вирусные линии, не имеющие связи с поездками, уже через три дня после первого обнаружения инфекции, что указывает на более раннее проникновение в Шотландию и распространение в сообществе до первого выявленного случая. «

«Появление континентальной Европы в качестве эпицентра глобальной пандемии COVID явилось явным фактором возникновения шотландской вспышки, при этом большинство линий, обнаруженных в этом исследовании, связаны с европейскими последовательностями. Случаи, связанные с Китаем и другими странами в Юго-Восточная Азия сравнительно не обнаружена. «

«Скорость распространения вируса в Шотландии и Великобритании в целом после многочисленных внедрений, в основном из других европейских стран, была чрезвычайно высокой. Возможно, более ранняя локализация из стран с высоким бременем случаев, таких как так как Италия и другие меры, такие как карантин путешественников из районов повышенного риска, могли бы предотвратить эскалацию вспышки и множественные скопления продолжающейся передачи от сообщества. «

«Отслеживание нового коронавируса с использованием секвенирования и фитоэпидемиологического анализа может помочь информировать нас о наших текущих ответных действиях и о результатах вмешательств общественного здравоохранения в режиме реального времени и является инструментом, который можно использовать для понимания будущих вспышек инфекционных заболеваний такого рода . «

Геномное секвенирование патогенов стало ключевым компонентом эпидемиологической реакции на вспышки вируса, например, Эбола в Демократической Республике Конго или Зика в Южной и Центральной Америке. В этом исследовании исследователи из Центра исследований вирусов Университета Глазго Университета Глазго, которые использовали эту технологию в Уганде, переключились на секвенирование вируса SARS-CoV-2 в Шотландии, наряду с партнерами NHS в Вирусологическом центре на западе Шотландии и Королевский лазарет Эдинбурга. Полученные данные дают ученым более глубокие знания о происхождении и передаче заболевания, а благодаря анализу внедрения COVID-19 в Шотландии информация о распространении и распространении вируса может помочь в принятии целевых мер общественного здравоохранения.

Профессор Томсон добавил: «Поскольку количество случаев в Шотландии уменьшается, наши данные о последовательностях могут служить основой для определения последовательности текущих инфекций в режиме реального времени, что может служить мерой для политиков в отношении успеха текущих мер и способствовать ослабление или ужесточение мер общественного здравоохранения. «

р. Кейт Темплтон, консультант по клиническим исследованиям, Университет Эдинбурга, сказала: «Внедрение этого подхода секвенирования стало отличным сотрудничеством между Университетом Глазго и Эдинбургским университетом. Работа в Эдинбурге для этого исследования была возможна только благодаря совместной работе с Университетом и ученые NHS. Текущая работа зависит от вклада сотрудников клинической и диагностической лаборатории NHS по всей Шотландии. Их усилия помогли нам создать действительно национальную картину внедрения и постоянного распространения вируса и предоставят важную информацию для руководства политиков как реагировать на эту пандемию. «

За период выборки (с 28 февраля 2020 года по 1 апреля 2020 года) было обнаружено 2310 положительных случаев COVID-19 (Scotland Open Data, statistics.gov.scot). Эти подтвержденные инфекции были связаны с 1832 госпитализациями, 207 реанимациями и 126 смертельными случаями.

Исследование «Геномная эпидемиология в течение первого месяца распространения SARS-CoV-2 в Шотландии подчеркивает роль европейских путешествий в появлении COVID-19», опубликовано в medRxiv./p>




Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *