lung
Кредит: CC0 Public Domain

Группа китайских ученых из Государственной ключевой лаборатории исследований лекарственных средств Шанхайского института Materia Medica при Академии наук Китая вместе с сотрудниками нескольких учреждений недавно представили подробный протеомный анализ на основе 103 китайских пациентов с легкими. аденокарцинома (LUAD), ведущая причина смерти среди всех видов рака во всем мире.

Исследование выявило молекулярные характеристики, связанные с LUAD, их связь с клиническими результатами, потенциальными прогностическими биомаркерами и лекарственными мишенями. Это исследование было опубликовано в Интернете в Cell 9 июля.

Несмотря на значительный прогресс в геномном исследовании LUAD в последние годы, большой процент пациентов с LUAD все еще не имеет целенаправленных терапевтических стратегий. Поскольку белки являются непосредственными исполнителями биологической активности, всестороннее протеомное исследование LUAD может заполнить пробел в знаниях между геномной аномалией и онкогенной функцией белка.

Чтобы обеспечить всестороннее понимание молекулярного ландшафта LUAD и предоставить возможность для более точной диагностики и лечения LUAD, ученые в этом исследовании выполнили комплексный протеомный и фосфопротеомный анализ опухолевых тканей и их парных нераковых соседних тканей от 103 пациентов с LUAD , Всего было идентифицировано 11 119 белков и 22 564 сайта фосфорилирования. Сочетая эти данные протеомики с клинической информацией и данными геномики, мы получили всеобъемлющий молекулярный ландшафт LUAD.

Ученые обнаружили, что эпителиально-мезенхимальный переход, а также воспалительные и онкогенные сигнальные пути, вероятно, приводят к плохому прогнозу на стадии I LUAD. Они также установили связь между генетическими изменениями и протеомными характеристиками у пациентов с мутацией EGFR или TP53, двух доминирующих генов-драйверов у китайских пациентов с LUAD.

Повышенные уровни экспрессии двух гистологических маркеров, TTF-1 и Napsin-A, и белков в сплайсосомах наблюдались у пациентов с мутацией EGFR. У пациентов с мутацией TP53 заметно изменились несколько онкогенных путей, включая репликацию ДНК и восстановление несоответствия.

Исследователи классифицировали всех пациентов на три протеомных подтипа (S-I, S-II, S-III), каждый из которых содержал различные молекулярные особенности и клинические признаки. Комплексный биоинформационный анализ показал, что пациенты с S-I были связаны с клеточной средой и хорошим прогнозом. Напротив, пациенты с S-III были связаны с пролиферацией клеток и стабильностью протеома и плохим прогнозом. Фосфопротеомный анализ также выявил активированные сигнальные пути и киназы в различных протеомных подтипах. Интегративный анализ данных протеомики и клинических данных также выявил 27 потенциальных биомаркеров плазмы и несколько лекарственных мишеней для LUAD. HSP 90β, один из потенциальных биомаркеров, был дополнительно подтвержден в независимой когорте.

Это исследование дает новое понимание LUAD за пределами текущего понимания генома. Протеомный набор данных служит ценным и мощным ресурсом для ускорения перевода фундаментальных исследований в более точную диагностику и терапевтические методы лечения в клинической практике.




Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *