Быстрый и экономичный метод отслеживания распространения COVID-19 через неочищенные сточные воды
Методы, использованные для восстановления MHV в этом исследовании. Наиболее успешным оказался метод (C), за ним последовал метод (B) (Вариш Ахмед и др., Science of The Total Environment, 5 июня 2020 г.). Предоставлено: Вариш Ахмед и др., Наука о всей окружающей среде, 5 июня 2020 г.

Отслеживание распространения пандемии COVID-19 в настоящее время проводится путем тестирования мазков из носа или образцов слюны. Инструменты и методы для отслеживания распространения пандемии другими способами были бы очень полезны; мониторинг сточных вод — это метод, который позволит нам отслеживать распространение пандемии в гораздо большем масштабе. Это не новый метод, и он использовался для обнаружения вирусов без оболочки, но традиционный метод для вирусов с оболочкой, таких как SARS-CoV-2, не был разработан.

В текущей работе, соавтором которой является доцент Масааки Китаджима из Технической лаборатории контроля качества воды Университета Хоккайдо, ученые сообщают о быстром и экономичном методе концентрирования коронавируса в неочищенных сточных водах. Вирус гепатита мышей (MHV), тип оболочечного вируса, тесно связан с SARS-CoV-2, но не влияет на людей, и поэтому его можно безопасно использовать для проверки применимости метода. Исследование было опубликовано в Science of the Total Environment.

Ученые получили MHV из фекалий мышей и ввели его в образцы неочищенных сточных вод, собранных в Брисбене, Австралия. Они попытались извлечь и сконцентрировать MHV из этих образцов семью различными методами, которые обычно используются для тестирования вирусов без оболочки. Количество выделенного MHV определяли методом, называемым количественной ПЦР с обратной транскрипцией, где РНК вируса извлекается, превращается в ДНК, ДНК многократно дублируется, а увеличение количества ДНК измеряется на протяжении всего процесса. р>

Выделение было самым высоким в методе, который включал обработку образца хлоридом магния и последующую фильтрацию вируса через отрицательно заряженную мембрану; второе по величине извлечение было получено аналогичным методом без хлорида магния. К преимуществам этих методов относится время начальной обработки менее 1 часа и необходимость только в дешевом, широко доступном оборудовании и реагентах. Также есть недостатки, такие как засорение фильтров, которые могут увеличить время обработки. Однако на сегодняшний день необходимость обратной транскрипции-КПЦР для обнаружения вируса неизбежна.

Следующим шагом будет тестирование этого метода на образцах, собранных в районах, где преобладает пандемия. Есть две цели: одна — показать, что метод может быть использован для SARS-CoV-2, а другая — показать, что тест может быть использован на образцах, взятых вне лаборатории.

«Я надеюсь, что это исследование внесет свой вклад в создание стандартного протокола для обнаружения SARS-CoV-2 в сточных водах, — говорит доцент Китадзима, — а это, в свою очередь, ускорит исследования, чтобы улучшить наше понимание COVID- 19 эпидемиологии через надзор за сточными водами «. В настоящее время он участвует в ряде исследований, связанных с применением эпидемиологии сточных вод для отслеживания распространения пандемии COVID-19, и сотрудничал с рядом ученых и исследовательских групп по всему миру в этих усилиях.




Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *